47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4474 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 170 aa  322  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  87.06 
 
 		 170 aa  288  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  58.82 
 
 		 170 aa  197  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  53.53 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  45.73 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  40.59 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  43.31 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  45.16 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  40.99 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  38.04 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  40.61 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  41.72 
 
 		 174 aa  94  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  42.41 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  44.38 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  43.48 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  38.79 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  40.12 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  39.74 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  38.57 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  41.96 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  35.04 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  44.68 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  36.6 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  37.31 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  38.83 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  37.18 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  33.92 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  32.7 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  32.7 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  32.08 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  36.84 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  34.81 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  30.97 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  33.59 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  31.13 
 
 		 162 aa  47.4  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  39.08 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  30.66 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  36.48 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  30.14 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  28.37 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  29.75 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  28.24 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  35.78 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  31.97 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  29.25 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1900  hypothetical protein  37.89 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  31.87 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>