32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0665 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 183 aa  359  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  93.99 
 
 		 183 aa  340  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  66.47 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  44.69 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  31.25 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  31.25 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  30.63 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  31.06 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  28.85 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  27.81 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  34.84 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  30 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  30.82 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  29.49 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  33.11 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  34.55 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  33.77 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  26.71 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  27.81 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  36.45 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  27.93 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  38.2 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  32.5 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  34.02 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  36.54 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  31.68 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  28.57 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  37.11 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  31.07 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  29.61 
 
 		 157 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  30.43 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>