44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2825 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 168 aa  318  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  85.71 
 
 		 168 aa  260  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  64.33 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  59.62 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  56.33 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  53.16 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  54.97 
 
 		 174 aa  147  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  58 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  53.85 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  56.13 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  54.84 
 
 		 174 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  53.5 
 
 		 174 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  56.05 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  56.69 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  52.45 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  41.57 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  40.24 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  47.06 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  40.25 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  44.85 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  38.04 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  39.63 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  44.06 
 
 		 170 aa  90.5  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  43.12 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  33.94 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  40.67 
 
 		 165 aa  85.9  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  41.29 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  33.8 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4406  peptidase A24A prepilin type IV  34.15 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  32 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  34.04 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  32.69 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  33.01 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  32.84 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  35.82 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  36.54 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  31.73 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  26.92 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  33.83 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  38.55 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  36.73 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  37.96 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  35.77 
 
 		 250 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>