41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2561 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 168 aa  321  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  54.55 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  55.9 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  52.23 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  50.98 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  49.67 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  51.63 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  50.33 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  51.59 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  51.97 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  50.66 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  52.94 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  50.33 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  47.37 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  48.59 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  39.51 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  38.71 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  39.35 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  41.25 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  46.26 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  37.79 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  44.52 
 
 		 170 aa  91.3  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  37.96 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  35.53 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  38.79 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  35.33 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  37.91 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  37.41 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  34.78 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  35.76 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  45 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  33.12 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  31.82 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  28.48 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  30.06 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  34.09 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2354  hypothetical protein  31.69 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.306931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  27.5 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1121  peptidase A24A prepilin type IV  34.75 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  0.89566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  29.37 
 
 		 291 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  32.14 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>