14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2354 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2354  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  326  8e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.306931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1121  peptidase A24A prepilin type IV  46.88 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  0.89566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0989  peptidase A24A, prepilin type IV  45.22 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0297  hypothetical protein  45.57 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0549  peptidase A24A, prepilin type IV  43.75 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1900  hypothetical protein  43.75 
 
 		 167 aa  97.1  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  33.07 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  31.3 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  35.87 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  29.93 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  29.36 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  31.65 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  32.53 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>