10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1121 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1121  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 169 aa  326  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  0.89566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0989  peptidase A24A, prepilin type IV  54.09 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0549  peptidase A24A, prepilin type IV  62.16 
 
 		 167 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1900  hypothetical protein  62.84 
 
 		 167 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0297  hypothetical protein  58.02 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2354  hypothetical protein  46.88 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.306931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  36.05 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  32.64 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  28.86 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  32.65 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>