48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3494 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 187 aa  351  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  64.33 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  66.87 
 
 		 168 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  65.36 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  60.39 
 
 		 169 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  57.5 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  61.07 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  55 
 
 		 174 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  58.13 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  58.13 
 
 		 174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  57.5 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  60.13 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  58.75 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  52.94 
 
 		 168 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  46.1 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  42.33 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  45.68 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  51.57 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  44.23 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  39.51 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  46.1 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  44.53 
 
 		 170 aa  97.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  42.33 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  47.71 
 
 		 170 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  41.98 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  37.5 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  32.68 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  35.42 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  33.75 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  31.87 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4406  peptidase A24A prepilin type IV  30.13 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  27.65 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  29.61 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  27.34 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0989  peptidase A24A, prepilin type IV  32.62 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  36.69 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  45.57 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1121  peptidase A24A prepilin type IV  33.1 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  0.89566 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  28.12 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  36.07 
 
 		 250 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0731  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465055  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  35.42 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  33.08 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  30.26 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  37.38 
 
 		 289 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  32.28 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  32.37 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  34.29 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>