45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4198 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 174 aa  338  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  82.46 
 
 		 174 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  73.41 
 
 		 174 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  69.94 
 
 		 174 aa  248  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  73.56 
 
 		 174 aa  246  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  75.14 
 
 		 174 aa  243  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  78.61 
 
 		 173 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  56.05 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  54.67 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  60.13 
 
 		 187 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  55.48 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  53.02 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  48.28 
 
 		 169 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  55.21 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  50.66 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  46.79 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  48.08 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  47.44 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  50.33 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  45.03 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  46.54 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  41.67 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  40.4 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  37.58 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  40.14 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  39.07 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  31.61 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  31.11 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  32.5 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  28.57 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  32.86 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  29.68 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  34.93 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  33.97 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  33.58 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  34.25 
 
 		 159 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  31.79 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  30.91 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  31.75 
 
 		 250 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  39.39 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  31.65 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1121  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  0.89566 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  37.93 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  38.46 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>