21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3485 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 162 aa  313  7e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  36.02 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2689  peptidase A24A prepilin type IV  39.1 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  34.87 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  29.03 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  32.9 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  34.16 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  27.7 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  30.43 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  39.74 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  32.08 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  30.87 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  29.61 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  32.29 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  35.71 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  30.26 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2457  peptidase A24A prepilin type IV  35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  26.71 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  28.08 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>