24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03359 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  100 
 
 		 147 aa  283  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  33.33 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  29.56 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06198  prepilin peptidase CpaA  38.96 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0603  peptidase A24A prepilin type IV  45.95 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  34.72 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  37.21 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0367  type IV leader peptidase  26.15 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0321504  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  34 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0687  peptidase A24A prepilin type IV  34.03 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  32.41 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  35.48 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3500  peptidase A24A, prepilin type IV  35.2 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  32.29 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  31.29 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  33.06 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0254  type IV prepilin peptidase family protein  37.66 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000335319  hitchhiker  0.00000137879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  29.79 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  26.97 
 
 		 192 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  30.07 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  31.97 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  28.08 
 
 		 174 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  29.7 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  29.86 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>