45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0221 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  100 
 
 		 172 aa  328  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  53.37 
 
 		 170 aa  175  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  54.66 
 
 		 170 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  53.53 
 
 		 170 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  36.84 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  36.42 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  39.63 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  41.45 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  40 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  40.27 
 
 		 168 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  40.97 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  40.26 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  38.85 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  37.39 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  40.13 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  38.41 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  43.66 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  44.83 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  40.44 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  35.92 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  34.25 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  40.14 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  35.53 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  38.52 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  34.59 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  30 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  29.94 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  36.5 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  34.03 
 
 		 132 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  32.5 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  30.3 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  34.95 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  32.14 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  31.68 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  33.96 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  32.69 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  31.78 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  29.31 
 
 		 218 aa  44.7  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  34.25 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  30.29 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  30.99 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  30.99 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  29.66 
 
 		 289 aa  41.2  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  30.67 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>