78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5501 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 179 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 179 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  98.32 
 
 		 179 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  90 
 
 		 180 aa  283  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  80.79 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  79.66 
 
 		 180 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  63.59 
 
 		 204 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  62.5 
 
 		 179 aa  203  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  63.59 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  63.59 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  48.84 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  47.85 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  45.76 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  42.2 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  43.35 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  44.24 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  44.44 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  43.2 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  38.89 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  36.26 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  47.5 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  32.12 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  29.82 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  38.71 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  43.86 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  36.51 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  42.16 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  40.4 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  40.4 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  40.4 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  40.4 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  40.4 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  40.4 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  40.4 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  28.49 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  41.38 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  38.78 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  39.25 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  41.67 
 
 		 164 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  41.67 
 
 		 164 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  41.67 
 
 		 164 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  27.74 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  31.9 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  37 
 
 		 167 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  32.68 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  33.53 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  33.33 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  30.86 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  30.86 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  33.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  34.36 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  31.58 
 
 		 172 aa  47.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.43 
 
 		 280 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  40.48 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  36.87 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  32.3 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  28.69 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  37.61 
 
 		 283 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  39.82 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.71 
 
 		 281 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  31.45 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  32.77 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  31.71 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  32.77 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  36.42 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  34.43 
 
 		 318 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  30.77 
 
 		 302 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.67 
 
 		 288 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  29.63 
 
 		 170 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  32.05 
 
 		 166 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  29.37 
 
 		 287 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3971  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0388817  normal  0.704263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  32.08 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  25.23 
 
 		 252 aa  41.2  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  33.09 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  31.43 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  32.5 
 
 		 309 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>