42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4094 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 173 aa  335  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  45.09 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  43.27 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  51.27 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  47.27 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  44.79 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  41.71 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  47.17 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  46.67 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  47.44 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  40.24 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  52.2 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  36.84 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  42.29 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  43.4 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  45.68 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  44.29 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  39.87 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  39.87 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  39.22 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  37.67 
 
 		 170 aa  97.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  40.29 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  39.87 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  42.58 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  35.9 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  37.06 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  31.61 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  33.12 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  38.54 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  35.35 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  27.54 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1121  peptidase A24A prepilin type IV  30.32 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  0.89566 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  37.78 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  32.62 
 
 		 167 aa  44.3  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  36.18 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  30.91 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  25.75 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  33.59 
 
 		 250 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  34.3 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  30.43 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  31.76 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>