27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1526 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 157 aa  305  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  41.23 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  35.77 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  35.67 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  34.93 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  35.17 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  38.1 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0603  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  35.37 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  33.58 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1081  peptidase A24A, prepilin type IV  36.84 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  34.69 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  34.39 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  31.01 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  41.41 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  32.14 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  37.62 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  31.91 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  33.67 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  33.59 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  35.04 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  39.78 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  36.78 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  35.59 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  24.69 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  32.45 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  31.21 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>