44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4195 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 170 aa  315  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  45.16 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  40.25 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  44.37 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  41.83 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  47.06 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  43.23 
 
 		 174 aa  103  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  47.06 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  44.37 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  47.18 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  45.03 
 
 		 174 aa  94  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  41.25 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  44.16 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  39.75 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  40.38 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  37.27 
 
 		 170 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  38.41 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  44.23 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  37.42 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  38.06 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  38.41 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  39.35 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  37.33 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  39.51 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  39.22 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  37.18 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  35.67 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  36.36 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  33.76 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  31.29 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  36.02 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  33.58 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  33.58 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  31.1 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  33.94 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  48.08 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  34.16 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  34.42 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  36.45 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  36.45 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  37.93 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4406  peptidase A24A prepilin type IV  29.94 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  31.48 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>