63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3004 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 151 aa  273  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3971  peptidase A24A prepilin type IV  41.44 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0388817  normal  0.704263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  41.29 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  35.53 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  39.58 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  37.33 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  37.97 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  42.11 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  42.11 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  42.11 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  34.93 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  32.68 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  39.87 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  40.13 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  39.87 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  34.19 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  38.31 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  38.31 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  33.11 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  34.59 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  36.02 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  34.04 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  37.42 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  34.06 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  32.9 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  38.26 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  32.03 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  31.08 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  36.42 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  35.48 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  36.54 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  30.26 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  39.29 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  37.96 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0603  peptidase A24A prepilin type IV  30 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  34.46 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  38.2 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  32.21 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  39.33 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  31.58 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  34.87 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  29.61 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  37.58 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  38.61 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  29.45 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  37.75 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  34.62 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  33.77 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  30.57 
 
 		 186 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  36.14 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  34.04 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  33.12 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2918  peptidase A24A prepilin type IV  36.62 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3146  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 147 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  30.07 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  31.9 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0604  peptidase A24A prepilin type IV  40.28 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.447619  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  30.63 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>