49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2743 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 196 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  63.64 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  57.95 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  40.7 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  38.95 
 
 		 189 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  39.33 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  30.72 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  40.48 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  35.93 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  42.22 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  38.75 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  37.79 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  38.42 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  38.76 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  38.76 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  38.76 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  37.87 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  27.33 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  40.91 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  40.12 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  36.52 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  38.82 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  37.71 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  38.82 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  37.87 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  39.53 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  32.46 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  32.22 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  32.74 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  41.82 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  34.76 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  31.58 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  50.56 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  28.74 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  40.59 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  30.67 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  30.67 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  37.17 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.17 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  41.18 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  44.3 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  33.05 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  40.38 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  33.05 
 
 		 274 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  38.1 
 
 		 187 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  36.67 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0364  leader peptidase TcpJ  30.63 
 
 		 253 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.692702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  36.59 
 
 		 246 aa  41.2  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>