33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0545 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  100 
 
 		 142 aa  278  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  35.88 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  44.05 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1745  Flp pilus assembly protein, protease CpaA  36.59 
 
 		 202 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  36.59 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  35.8 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  38.46 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  37.86 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 179 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 179 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  39.02 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  28.26 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  30.4 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  30.16 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  36.46 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  27.64 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  46.03 
 
 		 246 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  34.85 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  35.04 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  34.48 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  29.85 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  31.58 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  36.99 
 
 		 165 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 253 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  37.08 
 
 		 258 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  30.1 
 
 		 295 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  42.22 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  42.22 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  42.22 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5627  peptidase A24A prepilin type IV  42.59 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0178766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  40 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>