60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2545 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  100 
 
 
166 aa  318  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  92.77 
 
 
166 aa  253  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  91.57 
 
 
166 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  92.17 
 
 
166 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  92.17 
 
 
166 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  92.17 
 
 
166 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  92.17 
 
 
166 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  92.17 
 
 
166 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  60.24 
 
 
166 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  54.88 
 
 
165 aa  173  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  56.1 
 
 
165 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  53.01 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  52.41 
 
 
164 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  52.41 
 
 
164 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  52.41 
 
 
164 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  53.8 
 
 
166 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  53.8 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  45.13 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  38.12 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  41.18 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  34.69 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  34.69 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  37.97 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  35.45 
 
 
190 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  38.2 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  42.47 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  36.79 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  36.67 
 
 
178 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  35.48 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  39.53 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  39.73 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  39.73 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  39.73 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  35.48 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  31.13 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  43.24 
 
 
301 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.14 
 
 
288 aa  45.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.33 
 
 
273 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  37.14 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  40.86 
 
 
194 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  42.86 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  35.29 
 
 
283 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  33.94 
 
 
181 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  37.5 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  39.05 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  39.05 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  39.05 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  30.1 
 
 
166 aa  42  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  30.61 
 
 
239 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  32.26 
 
 
183 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  28.99 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  30.36 
 
 
269 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  30.36 
 
 
269 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  26.54 
 
 
300 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  35.29 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  34 
 
 
287 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  30.91 
 
 
155 aa  41.2  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  34 
 
 
283 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  30.91 
 
 
155 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0364  leader peptidase TcpJ  29 
 
 
253 aa  40.8  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.692702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>