61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4612 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 178 aa  347  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  52.25 
 
 		 178 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  44.12 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  43.93 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  44.51 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  44.51 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  42.94 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  43.35 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  42.26 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  43.35 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  43.35 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  42.37 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  42.37 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  43.1 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  40.25 
 
 		 179 aa  97.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  41.95 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  39.47 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  35.88 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  44.12 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  36.02 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  36.52 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  40.61 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  36.2 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  32.67 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  32.67 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  32.6 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  32.47 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  27.56 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  31.03 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  28.21 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  31.76 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  36.26 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  36.75 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  30.65 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  35.58 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  35.58 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  35.58 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  35.58 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  35.58 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  35.58 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  34.62 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  32.5 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  35.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  42.11 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  30.25 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  35.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  35.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  32.41 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5627  peptidase A24A prepilin type IV  34.75 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0178766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  32.53 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  28.3 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  38.67 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  31.48 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  32.69 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  32.67 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  28.95 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2457  peptidase A24A prepilin type IV  30.61 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  31.25 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  36.17 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  54.55 
 
 		 287 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>