29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2457 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2457  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 
147 aa  281  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.25 
 
 
303 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  36.25 
 
 
303 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  36.25 
 
 
303 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  36.25 
 
 
303 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  36.25 
 
 
303 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  30 
 
 
303 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  35 
 
 
303 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  27.82 
 
 
318 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  27.74 
 
 
309 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  30.99 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  26.72 
 
 
283 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  26.92 
 
 
289 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.34 
 
 
280 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.52 
 
 
288 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  26.32 
 
 
291 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0731  peptidase A24A, prepilin type IV  36.45 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  27.13 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  31.43 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  30.61 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.7 
 
 
293 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  28.7 
 
 
293 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  32.97 
 
 
289 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  34.15 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  36.36 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  31.87 
 
 
283 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.39 
 
 
297 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0809  peptidase A24A, prepilin type IV  34.58 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  29.13 
 
 
178 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>