55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0231 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 187 aa  359  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  52.15 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  51.45 
 
 		 174 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  49.69 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  49.69 
 
 		 174 aa  148  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  52.23 
 
 		 174 aa  147  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  55.21 
 
 		 174 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  53.59 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  52.76 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  50.69 
 
 		 168 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  48.23 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  44.16 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  50.31 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  45.89 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  45.86 
 
 		 169 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  44.3 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  43.8 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  43.87 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  44.7 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  41.78 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  42.58 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  36.88 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  37.42 
 
 		 170 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  33.73 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  36.88 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  35.81 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  36.59 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4406  peptidase A24A prepilin type IV  31.52 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  36.22 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  33.12 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  35.8 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  33.83 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  33.56 
 
 		 151 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  34.85 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  28.69 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  31.37 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  37.11 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  32.35 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06198  prepilin peptidase CpaA  29.29 
 
 		 112 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  28.7 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  33.72 
 
 		 291 aa  45.1  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  29.55 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  30.56 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  30.56 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  35.58 
 
 		 168 aa  44.7  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  33.53 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1121  peptidase A24A prepilin type IV  30.99 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  0.89566 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  28.57 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  28.79 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.51 
 
 		 273 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.37 
 
 		 283 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  30.92 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  34.07 
 
 		 248 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  33.33 
 
 		 289 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  33.02 
 
 		 281 aa  41.2  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>