13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4589 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 156 aa  309  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  89.74 
 
 		 156 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  86.54 
 
 		 156 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  86.54 
 
 		 156 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  58.33 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  51.28 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4375  peptidase A24A, prepilin type IV  47.68 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4835  hypothetical protein  46.79 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  30.92 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  29.79 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  33.61 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  29.17 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>