13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4862 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  280  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  76.98 
 
 		 160 aa  215  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  36.44 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  36.44 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  36.44 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  48.65 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  30.69 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  30.08 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  39.19 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4375  peptidase A24A, prepilin type IV  36.25 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  31.75 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  37.33 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  36.92 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>