23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2461 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2461  CpaA2 pilus assembly protein, putative  100 
 
 
161 aa  293  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0823  putative fimbriae assembly-related protein  90.57 
 
 
159 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0431004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0338  putative fimbriae assembly-related protein  90.57 
 
 
159 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1682  A24 family peptidase  90.57 
 
 
159 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1883  peptidase A24A, prepilin type IV  90.57 
 
 
172 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1871  peptidase A24A, prepilin type IV  91.19 
 
 
172 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2038  putative fimbriae assembly-related protein  90.57 
 
 
176 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  50.99 
 
 
157 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  46.36 
 
 
159 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  45.03 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  32.59 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  36.92 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  34.71 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  34.71 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  28.67 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  28.37 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  30.66 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  34.04 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  39.53 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  34.34 
 
 
174 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  32.62 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  30.87 
 
 
171 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>