28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2830 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2830  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 169 aa  297  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2918  peptidase A24A prepilin type IV  86.98 
 
 		 170 aa  233  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  41.12 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  42.18 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3971  peptidase A24A prepilin type IV  44.97 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0388817  normal  0.704263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  37.32 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  31.1 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  35.06 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  34.13 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  32.5 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  33.14 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  35.95 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  33.1 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  35.78 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  36.54 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  40.88 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  40.99 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  40.88 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  40.88 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  29.63 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  35.23 
 
 		 170 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  40.62 
 
 		 180 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  35.96 
 
 		 168 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  38.04 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  29.3 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  38.04 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  38.04 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>