More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4265 on replicon NC_009008
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009008  RSP_4265  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.828817  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1466  helix-turn-helix domain-containing protein  92.71 
 
 		 193 aa  325  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  38.07 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  34.22 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.18 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  31.65 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.35 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  28.35 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 271 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  32.27 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  34.68 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  33.48 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 269 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 270 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  25.49 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  35 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.38 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  27.11 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 450 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 261 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  31.44 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  36.82 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>