211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2283 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  76.8 
 
 		 1205 aa  1909    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2283  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1220 aa  2468    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268234 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0285  putative DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.87 
 
 		 1226 aa  1167    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  34.06 
 
 		 1216 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.17 
 
 		 1203 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  31.51 
 
 		 1187 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  25.69 
 
 		 693 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.55 
 
 		 791 aa  99  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  23.9 
 
 		 882 aa  98.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  22.69 
 
 		 1173 aa  97.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.5 
 
 		 1166 aa  96.3  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.32 
 
 		 1056 aa  92.8  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  22.16 
 
 		 1173 aa  91.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.33 
 
 		 715 aa  89.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  26.45 
 
 		 1165 aa  89.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.02 
 
 		 1053 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.54 
 
 		 1197 aa  85.5  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  24.05 
 
 		 760 aa  82.8  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.9 
 
 		 799 aa  81.6  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.91 
 
 		 1054 aa  79  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  27.91 
 
 		 1054 aa  79  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  26.23 
 
 		 712 aa  78.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  24.5 
 
 		 723 aa  77.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  26.43 
 
 		 824 aa  75.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  24.31 
 
 		 1767 aa  73.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  27.89 
 
 		 808 aa  72  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  25 
 
 		 2189 aa  71.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  24.66 
 
 		 2157 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  32.12 
 
 		 727 aa  69.7  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.07 
 
 		 988 aa  69.3  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  30.7 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.21 
 
 		 1085 aa  68.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  24.9 
 
 		 2208 aa  66.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.06 
 
 		 817 aa  66.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.35 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.18 
 
 		 729 aa  64.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.79 
 
 		 1465 aa  64.3  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.43 
 
 		 751 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.53 
 
 		 739 aa  61.6  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  22.6 
 
 		 2111 aa  61.6  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  22.79 
 
 		 1770 aa  61.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.13 
 
 		 1064 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 		 707 aa  59.7  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  26.7 
 
 		 799 aa  59.3  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.71 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 746 aa  59.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  24.32 
 
 		 2152 aa  58.9  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  28.35 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1051 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.34 
 
 		 1110 aa  57.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000467672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  25.49 
 
 		 758 aa  57.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.45 
 
 		 707 aa  57.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.11 
 
 		 854 aa  57  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.46 
 
 		 706 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  34.31 
 
 		 842 aa  57  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10148  ATP-independent RNA helicase  34.59 
 
 		 437 aa  57  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.42 
 
 		 868 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.16 
 
 		 708 aa  57  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29 
 
 		 710 aa  57.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.47 
 
 		 838 aa  56.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  22.45 
 
 		 919 aa  56.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  21.5 
 
 		 1003 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.92 
 
 		 1265 aa  56.6  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.12 
 
 		 852 aa  55.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.12 
 
 		 852 aa  55.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.12 
 
 		 852 aa  55.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.88 
 
 		 996 aa  55.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  35.23 
 
 		 885 aa  55.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  22.72 
 
 		 905 aa  55.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3576  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.48 
 
 		 1048 aa  55.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  29.14 
 
 		 830 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  33.33 
 
 		 1589 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 832 aa  54.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  30.09 
 
 		 1060 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  22.78 
 
 		 935 aa  54.3  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.67 
 
 		 709 aa  54.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  20.73 
 
 		 1032 aa  54.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  34.31 
 
 		 855 aa  53.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  22.27 
 
 		 926 aa  54.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.09 
 
 		 827 aa  53.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 851 aa  54.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28 
 
 		 707 aa  53.5  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 837 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  33.33 
 
 		 860 aa  53.5  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  31.51 
 
 		 940 aa  53.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.95 
 
 		 861 aa  53.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  30.99 
 
 		 936 aa  53.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.35 
 
 		 785 aa  53.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  23.01 
 
 		 908 aa  53.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.59 
 
 		 799 aa  53.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  28.48 
 
 		 877 aa  53.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3765  helicase domain-containing protein  33.91 
 
 		 1103 aa  52.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.63 
 
 		 780 aa  52.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.95 
 
 		 894 aa  52.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  38.64 
 
 		 885 aa  52.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.82 
 
 		 873 aa  52.4  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.82 
 
 		 870 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  21.93 
 
 		 908 aa  52.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>