220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5115 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  100 
 
 
1205 aa  2435    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0285  putative DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.86 
 
 
1226 aa  1147    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2283  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  76.8 
 
 
1220 aa  1889    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  33.81 
 
 
1216 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.78 
 
 
1203 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  32.64 
 
 
1187 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  25.36 
 
 
1173 aa  105  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  25.29 
 
 
1173 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.28 
 
 
1166 aa  99.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  26.28 
 
 
882 aa  97.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.14 
 
 
715 aa  94.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  27.21 
 
 
1165 aa  89  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  26.89 
 
 
693 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.92 
 
 
1056 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  25.06 
 
 
729 aa  81.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  23.12 
 
 
1053 aa  78.6  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.62 
 
 
1197 aa  77.4  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  24.09 
 
 
712 aa  76.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.05 
 
 
1054 aa  75.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  26.05 
 
 
1054 aa  75.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  23.06 
 
 
1767 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  26.46 
 
 
808 aa  73.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.67 
 
 
694 aa  73.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  23.51 
 
 
1770 aa  72  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  25.11 
 
 
824 aa  71.6  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  31.55 
 
 
727 aa  71.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.54 
 
 
791 aa  70.1  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  23.35 
 
 
2111 aa  69.7  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.56 
 
 
751 aa  69.3  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  24.03 
 
 
726 aa  69.7  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  24.61 
 
 
2189 aa  68.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.92 
 
 
868 aa  68.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  24.16 
 
 
1589 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  30.89 
 
 
760 aa  67.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 
747 aa  66.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.52 
 
 
856 aa  66.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 
747 aa  66.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  24.15 
 
 
2208 aa  66.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  30.24 
 
 
723 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.63 
 
 
799 aa  65.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.51 
 
 
707 aa  65.1  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.1 
 
 
988 aa  64.3  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.88 
 
 
746 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.51 
 
 
707 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  24.32 
 
 
2157 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  23.88 
 
 
869 aa  62.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
700 aa  62.8  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.93 
 
 
739 aa  62.4  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.62 
 
 
1465 aa  62  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.21 
 
 
785 aa  62  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.5 
 
 
1265 aa  61.6  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.19 
 
 
729 aa  61.6  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  28.02 
 
 
799 aa  61.6  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.41 
 
 
1032 aa  61.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.41 
 
 
1064 aa  60.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.85 
 
 
800 aa  60.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 
707 aa  60.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.03 
 
 
817 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  22.25 
 
 
905 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  21.76 
 
 
1003 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  24.2 
 
 
2152 aa  57.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.88 
 
 
706 aa  57.4  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  21.79 
 
 
828 aa  57.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.56 
 
 
996 aa  58.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.91 
 
 
709 aa  57.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  24.17 
 
 
926 aa  57  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.39 
 
 
1085 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  32.98 
 
 
758 aa  56.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.3 
 
 
780 aa  56.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  24.37 
 
 
2015 aa  55.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  22.96 
 
 
908 aa  55.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  21.72 
 
 
927 aa  55.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  32.19 
 
 
940 aa  55.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.89 
 
 
854 aa  55.5  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10148  ATP-independent RNA helicase  34.59 
 
 
437 aa  55.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.43 
 
 
803 aa  55.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  23.58 
 
 
1051 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  30.66 
 
 
421 aa  53.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  30.28 
 
 
936 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.09 
 
 
866 aa  53.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
710 aa  53.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  32.35 
 
 
855 aa  53.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.47 
 
 
838 aa  53.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.99 
 
 
947 aa  53.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  30.77 
 
 
860 aa  53.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3576  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.02 
 
 
1048 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  33.08 
 
 
1060 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  33.65 
 
 
885 aa  52.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.35 
 
 
952 aa  52.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  29.8 
 
 
839 aa  52.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.51 
 
 
917 aa  52.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.94 
 
 
950 aa  52  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.6 
 
 
799 aa  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  31.37 
 
 
842 aa  52  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  30.6 
 
 
799 aa  51.6  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  31.69 
 
 
918 aa  51.6  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34 
 
 
835 aa  50.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.13 
 
 
801 aa  51.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.74 
 
 
1110 aa  51.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000467672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  30.19 
 
 
935 aa  51.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>