225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3765 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3765  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1103 aa  2219    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.19 
 
 		 1110 aa  889    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000467672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3576  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.01 
 
 		 1048 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  28.89 
 
 		 1055 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  27.66 
 
 		 926 aa  110  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  26.8 
 
 		 1173 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  26.75 
 
 		 924 aa  105  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.69 
 
 		 927 aa  99  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  26.69 
 
 		 927 aa  98.2  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1051 aa  96.3  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  26.04 
 
 		 893 aa  96.3  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  25.82 
 
 		 906 aa  93.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  27.71 
 
 		 952 aa  92.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.46 
 
 		 1032 aa  92.8  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 1166 aa  92  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  25.54 
 
 		 908 aa  92.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.75 
 
 		 996 aa  90.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  25.85 
 
 		 890 aa  89.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.46 
 
 		 815 aa  89  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.27 
 
 		 984 aa  89  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  30.08 
 
 		 1173 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.38 
 
 		 929 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.32 
 
 		 1085 aa  86.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.94 
 
 		 918 aa  85.1  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.94 
 
 		 918 aa  85.1  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.94 
 
 		 918 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  25.11 
 
 		 904 aa  84  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.58 
 
 		 1032 aa  83.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.39 
 
 		 950 aa  82  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  24.12 
 
 		 909 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.43 
 
 		 952 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  28.74 
 
 		 1165 aa  80.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.65 
 
 		 739 aa  79.7  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  24.73 
 
 		 877 aa  78.6  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.07 
 
 		 709 aa  77  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  31.12 
 
 		 882 aa  75.5  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.97 
 
 		 1197 aa  75.5  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  31.5 
 
 		 1293 aa  74.7  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  27.78 
 
 		 933 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  33.93 
 
 		 924 aa  73.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  42.27 
 
 		 908 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  42.86 
 
 		 908 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  42.86 
 
 		 908 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 1068 aa  69.7  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.95 
 
 		 917 aa  69.3  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  28.3 
 
 		 693 aa  68.9  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  40.4 
 
 		 1767 aa  68.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  31.36 
 
 		 1003 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  29 
 
 		 1185 aa  67.8  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  26.73 
 
 		 729 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  36.99 
 
 		 712 aa  67.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  30.17 
 
 		 1023 aa  66.6  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  42.31 
 
 		 924 aa  66.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  32.12 
 
 		 961 aa  66.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  24.31 
 
 		 998 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.37 
 
 		 1054 aa  65.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  26.37 
 
 		 1054 aa  65.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  22.1 
 
 		 1205 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  44.19 
 
 		 2189 aa  65.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.14 
 
 		 964 aa  65.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  36.17 
 
 		 1942 aa  65.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.55 
 
 		 762 aa  64.3  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  41.84 
 
 		 905 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  25.56 
 
 		 1073 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.9 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  34.62 
 
 		 824 aa  63.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  37.78 
 
 		 2015 aa  63.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  43.82 
 
 		 2152 aa  62.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.53 
 
 		 799 aa  63.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  30.77 
 
 		 1239 aa  63.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  32.34 
 
 		 1770 aa  62.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  31.33 
 
 		 1026 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  23.81 
 
 		 1465 aa  62.4  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  27.49 
 
 		 760 aa  62  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.56 
 
 		 933 aa  62.4  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.34 
 
 		 424 aa  62  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  42.11 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  34.75 
 
 		 877 aa  61.6  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.62 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.79 
 
 		 865 aa  61.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  29.34 
 
 		 953 aa  60.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.6 
 
 		 894 aa  61.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.27 
 
 		 1056 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.52 
 
 		 715 aa  60.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  36.63 
 
 		 869 aa  60.1  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.88 
 
 		 951 aa  60.1  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  36.63 
 
 		 885 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.79 
 
 		 981 aa  60.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  32.56 
 
 		 2111 aa  60.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  28.99 
 
 		 967 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  28.99 
 
 		 967 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.41 
 
 		 800 aa  60.1  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  29.82 
 
 		 994 aa  59.3  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.96 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  37.5 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  25.97 
 
 		 1068 aa  59.7  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.06 
 
 		 700 aa  59.7  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  28.48 
 
 		 936 aa  59.3  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  39.13 
 
 		 855 aa  59.3  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>