More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3380 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  61.9 
 
 
1187 aa  1427    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  67.98 
 
 
1216 aa  1607    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
1203 aa  2409    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.78 
 
 
1205 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2283  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.31 
 
 
1220 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268234 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0285  putative DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.05 
 
 
1226 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  25.63 
 
 
882 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  26.29 
 
 
1165 aa  139  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  26.25 
 
 
1173 aa  136  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  26.17 
 
 
1173 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.02 
 
 
1197 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
1166 aa  121  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.45 
 
 
1032 aa  112  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.3 
 
 
715 aa  103  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.28 
 
 
707 aa  94.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 
694 aa  94  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.63 
 
 
1032 aa  92.8  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.41 
 
 
1085 aa  90.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  24.83 
 
 
693 aa  89  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.39 
 
 
1465 aa  89  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  26.54 
 
 
1054 aa  84  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.54 
 
 
1054 aa  84  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.94 
 
 
1064 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  23.11 
 
 
1051 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  22.28 
 
 
2208 aa  78.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  24.33 
 
 
1767 aa  79  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.67 
 
 
863 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  22.67 
 
 
863 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  26.18 
 
 
729 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  26.86 
 
 
824 aa  75.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  25.38 
 
 
723 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.21 
 
 
708 aa  74.3  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  24.01 
 
 
893 aa  73.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  23.52 
 
 
908 aa  72.8  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  24.78 
 
 
889 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.81 
 
 
866 aa  72.4  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.89 
 
 
952 aa  72.4  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  36.89 
 
 
869 aa  72.4  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  34.48 
 
 
1185 aa  72  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.83 
 
 
856 aa  72  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  22.45 
 
 
2111 aa  72  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.86 
 
 
894 aa  71.6  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.89 
 
 
873 aa  71.6  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  24.73 
 
 
1060 aa  71.6  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.64 
 
 
847 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  23.3 
 
 
908 aa  70.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  22.82 
 
 
2189 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.86 
 
 
847 aa  70.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  24.84 
 
 
904 aa  69.7  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  36.89 
 
 
885 aa  69.7  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  35.07 
 
 
952 aa  69.7  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  23.39 
 
 
908 aa  69.7  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.58 
 
 
838 aa  69.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.89 
 
 
861 aa  69.3  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  33.98 
 
 
855 aa  68.9  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.98 
 
 
869 aa  68.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  24.89 
 
 
1589 aa  69.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.98 
 
 
870 aa  68.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.92 
 
 
831 aa  68.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.36 
 
 
950 aa  68.2  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.64 
 
 
848 aa  68.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.01 
 
 
851 aa  68.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  34.41 
 
 
1239 aa  68.6  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.6 
 
 
836 aa  67.4  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.01 
 
 
852 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  32.69 
 
 
860 aa  67.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  32.74 
 
 
853 aa  67.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.01 
 
 
852 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 
865 aa  67.4  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.01 
 
 
852 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.01 
 
 
950 aa  68.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.66 
 
 
837 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  32.54 
 
 
1073 aa  67.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.01 
 
 
827 aa  67  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  34.65 
 
 
877 aa  67.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  27.8 
 
 
1055 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  39.77 
 
 
961 aa  67  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.66 
 
 
791 aa  67  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  35.92 
 
 
842 aa  67.4  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  33.59 
 
 
967 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  33.98 
 
 
885 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  33.59 
 
 
967 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  30.84 
 
 
842 aa  66.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  35.48 
 
 
1293 aa  65.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.98 
 
 
832 aa  66.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.83 
 
 
988 aa  66.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.53 
 
 
868 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.65 
 
 
835 aa  65.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.98 
 
 
853 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.98 
 
 
1231 aa  65.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  30.05 
 
 
760 aa  65.5  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  36.73 
 
 
905 aa  65.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  36.96 
 
 
972 aa  65.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 
1068 aa  65.1  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.46 
 
 
947 aa  65.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  22.25 
 
 
1942 aa  64.7  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.62 
 
 
832 aa  64.3  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.41 
 
 
876 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  38.04 
 
 
936 aa  64.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  33.33 
 
 
1068 aa  64.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>