298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1063 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1032 aa  2106    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.87 
 
 
1064 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.26 
 
 
1032 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  28.86 
 
 
882 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  28.97 
 
 
1173 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.31 
 
 
1197 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.52 
 
 
1166 aa  144  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  27.55 
 
 
1173 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  25.05 
 
 
1165 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  27.65 
 
 
874 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  28.81 
 
 
693 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.29 
 
 
707 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  25.8 
 
 
1051 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  28.44 
 
 
712 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 
747 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.41 
 
 
709 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.19 
 
 
694 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.94 
 
 
662 aa  110  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.25 
 
 
791 aa  108  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  25.1 
 
 
808 aa  106  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  27.27 
 
 
1054 aa  107  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.62 
 
 
1085 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  26.64 
 
 
727 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.27 
 
 
1054 aa  107  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.54 
 
 
746 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.31 
 
 
747 aa  106  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.41 
 
 
751 aa  106  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.71 
 
 
707 aa  105  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.83 
 
 
707 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  26.01 
 
 
729 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  26.01 
 
 
723 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  25.62 
 
 
824 aa  102  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.41 
 
 
1203 aa  101  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  26.06 
 
 
760 aa  100  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.52 
 
 
868 aa  98.6  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.94 
 
 
799 aa  98.2  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  25.95 
 
 
799 aa  97.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.64 
 
 
706 aa  97.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.98 
 
 
1110 aa  96.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000467672 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  25.52 
 
 
1187 aa  94.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3576  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.55 
 
 
1048 aa  93.2  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  26.05 
 
 
1216 aa  92  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  28.08 
 
 
901 aa  91.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.76 
 
 
739 aa  91.3  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.22 
 
 
863 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  23.22 
 
 
863 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.42 
 
 
1053 aa  90.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.01 
 
 
1465 aa  89  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  25.65 
 
 
858 aa  88.2  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.27 
 
 
700 aa  87  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  26.27 
 
 
852 aa  87  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.44 
 
 
715 aa  86.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  25.59 
 
 
869 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  26.97 
 
 
1710 aa  85.1  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  23.53 
 
 
726 aa  84  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3765  helicase domain-containing protein  30.58 
 
 
1103 aa  83.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197555  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.87 
 
 
708 aa  83.2  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  25.24 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.11 
 
 
1318 aa  82.4  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.54 
 
 
710 aa  79.7  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  26.4 
 
 
855 aa  79.7  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.82 
 
 
729 aa  79  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.36 
 
 
1265 aa  78.6  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.12 
 
 
807 aa  77.4  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.49 
 
 
894 aa  77.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  24.37 
 
 
919 aa  77.4  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.61 
 
 
785 aa  77  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  23.99 
 
 
1767 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 
803 aa  77  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.9 
 
 
988 aa  75.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  23.71 
 
 
918 aa  75.1  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  21.92 
 
 
758 aa  75.1  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  25.75 
 
 
908 aa  75.1  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.51 
 
 
800 aa  75.1  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.6 
 
 
996 aa  73.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.78 
 
 
927 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  21.1 
 
 
872 aa  73.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  23.83 
 
 
906 aa  73.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.68 
 
 
780 aa  74.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  25.78 
 
 
927 aa  74.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  22.72 
 
 
849 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  23.44 
 
 
877 aa  73.6  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.79 
 
 
820 aa  73.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  24.88 
 
 
889 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  21.59 
 
 
924 aa  72.4  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  25.11 
 
 
908 aa  72  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  23.35 
 
 
1942 aa  72  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  25.87 
 
 
1589 aa  72  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  25.93 
 
 
952 aa  71.6  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  22.45 
 
 
926 aa  71.2  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.63 
 
 
856 aa  71.2  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  25.23 
 
 
842 aa  70.9  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  25.85 
 
 
869 aa  70.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.82 
 
 
950 aa  70.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.25 
 
 
853 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.08 
 
 
832 aa  70.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.79 
 
 
833 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.08 
 
 
870 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  23.84 
 
 
908 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.71 
 
 
831 aa  70.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>