208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1492 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  100 
 
 		 758 aa  1551    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.44 
 
 		 1032 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  25.91 
 
 		 828 aa  107  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.37 
 
 		 863 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  25.37 
 
 		 863 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  25.65 
 
 		 852 aa  99  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.32 
 
 		 868 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.47 
 
 		 1085 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.01 
 
 		 856 aa  91.3  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  25.14 
 
 		 858 aa  87.4  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  24.2 
 
 		 869 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  21.19 
 
 		 882 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1051 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.97 
 
 		 803 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.82 
 
 		 785 aa  75.5  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.92 
 
 		 1032 aa  75.1  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  22.48 
 
 		 1173 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  22.82 
 
 		 1173 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.72 
 
 		 780 aa  72.4  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.16 
 
 		 800 aa  72.4  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  24.54 
 
 		 729 aa  72  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  22.42 
 
 		 760 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  23.21 
 
 		 1054 aa  70.1  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.21 
 
 		 1054 aa  70.1  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.28 
 
 		 1197 aa  70.1  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.47 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.1 
 
 		 807 aa  67.4  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.17 
 
 		 1064 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  21.52 
 
 		 824 aa  66.6  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.63 
 
 		 791 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.72 
 
 		 756 aa  64.7  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0285  putative DEAD/DEAH box helicase-like protein  21.58 
 
 		 1226 aa  65.1  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3328  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.8 
 
 		 717 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.953553  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23 
 
 		 715 aa  63.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 		 739 aa  63.9  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  24.57 
 
 		 2157 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.54 
 
 		 1053 aa  63.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.78 
 
 		 1056 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  32.08 
 
 		 849 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 919 aa  60.8  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.07 
 
 		 869 aa  60.1  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.63 
 
 		 856 aa  60.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  30 
 
 		 893 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  20.25 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  34.44 
 
 		 855 aa  58.9  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  30.53 
 
 		 967 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  32.29 
 
 		 885 aa  58.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  27.71 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  27.43 
 
 		 842 aa  58.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2283  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.49 
 
 		 1220 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268234 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  23.83 
 
 		 1767 aa  57.4  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34 
 
 		 865 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  32.94 
 
 		 1165 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  20.97 
 
 		 727 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.98 
 
 		 1205 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.01 
 
 		 835 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  34.94 
 
 		 1187 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 831 aa  56.6  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 		 832 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 		 706 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0228  hypothetical protein  24.55 
 
 		 703 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515095  normal  0.0720823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.88 
 
 		 1004 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 		 832 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.25 
 
 		 710 aa  55.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  21.27 
 
 		 927 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.07 
 
 		 853 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  29.13 
 
 		 890 aa  55.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  31.91 
 
 		 842 aa  55.8  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  21.27 
 
 		 927 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.48 
 
 		 708 aa  55.8  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  33.33 
 
 		 1185 aa  55.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  22.07 
 
 		 693 aa  55.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.96 
 
 		 843 aa  55.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  32.22 
 
 		 853 aa  55.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  32 
 
 		 830 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  34.52 
 
 		 860 aa  55.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 885 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.03 
 
 		 870 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.69 
 
 		 852 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.69 
 
 		 852 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.69 
 
 		 852 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 		 827 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 		 1203 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 		 921 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  29.73 
 
 		 1055 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.89 
 
 		 838 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.53 
 
 		 952 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.94 
 
 		 851 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.94 
 
 		 837 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  21.05 
 
 		 808 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  23.48 
 
 		 874 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 836 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  25.43 
 
 		 891 aa  52.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  34.83 
 
 		 877 aa  52.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  31.58 
 
 		 940 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 		 861 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.77 
 
 		 932 aa  52.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.58 
 
 		 837 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  38.55 
 
 		 906 aa  52  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.59 
 
 		 1166 aa  52.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>