More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3383 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  56.93 
 
 
869 aa  938    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
868 aa  1758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.03 
 
 
863 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  35.03 
 
 
863 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  34.26 
 
 
852 aa  432  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  29.67 
 
 
849 aa  330  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  29.89 
 
 
858 aa  291  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  25.62 
 
 
828 aa  163  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.48 
 
 
267 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.56 
 
 
856 aa  125  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  27.59 
 
 
1051 aa  111  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3328  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.54 
 
 
717 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.953553  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.42 
 
 
791 aa  104  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.46 
 
 
709 aa  100  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  26.52 
 
 
1054 aa  99.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.52 
 
 
1054 aa  99.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.52 
 
 
1032 aa  98.6  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  27.19 
 
 
824 aa  97.8  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 
799 aa  97.4  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.75 
 
 
707 aa  97.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0781  helicase-like  24.94 
 
 
699 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  26.32 
 
 
758 aa  96.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.1 
 
 
780 aa  95.5  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.28 
 
 
803 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.52 
 
 
1053 aa  92.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.29 
 
 
1085 aa  92.8  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.49 
 
 
707 aa  92  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.13 
 
 
707 aa  91.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  26.12 
 
 
726 aa  90.9  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.61 
 
 
785 aa  90.5  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.46 
 
 
807 aa  89.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.3 
 
 
1056 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  26.92 
 
 
712 aa  88.2  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.13 
 
 
800 aa  88.2  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  23.26 
 
 
2208 aa  87.8  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 
747 aa  87.4  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  29.01 
 
 
1165 aa  85.9  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  27.99 
 
 
799 aa  85.1  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  28.53 
 
 
723 aa  84.7  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.08 
 
 
1064 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 
747 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  27.34 
 
 
1173 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.2 
 
 
746 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.91 
 
 
1197 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  24.94 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  27.71 
 
 
808 aa  82.8  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.1 
 
 
694 aa  82.8  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2652  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.82 
 
 
147 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18308  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  25.59 
 
 
693 aa  82.4  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  27.84 
 
 
729 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.22 
 
 
751 aa  81.3  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  25.25 
 
 
2189 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.34 
 
 
739 aa  79.7  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  25.17 
 
 
2111 aa  77.8  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  23.26 
 
 
2152 aa  77.8  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  24.69 
 
 
2157 aa  77.4  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  26.52 
 
 
1173 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  24.64 
 
 
926 aa  77  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  24.51 
 
 
874 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  23.68 
 
 
924 aa  75.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 
1004 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.19 
 
 
662 aa  75.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.2 
 
 
861 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0228  hypothetical protein  24.54 
 
 
703 aa  75.5  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515095  normal  0.0720823 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  27.69 
 
 
853 aa  75.5  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.16 
 
 
700 aa  75.5  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1048  helicase domain protein  38.37 
 
 
729 aa  75.1  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.28 
 
 
715 aa  75.1  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  25.54 
 
 
901 aa  74.7  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4880  helicase domain protein  26.29 
 
 
713 aa  74.7  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.756208 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.5 
 
 
756 aa  74.7  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.27 
 
 
817 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  24.44 
 
 
919 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.01 
 
 
1004 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27 
 
 
946 aa  73.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.03 
 
 
1032 aa  72.4  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  27.3 
 
 
869 aa  72  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.85 
 
 
708 aa  72  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.39 
 
 
1318 aa  72  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.94 
 
 
845 aa  71.2  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  22.65 
 
 
908 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  27.54 
 
 
885 aa  70.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  25.94 
 
 
813 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  26.21 
 
 
905 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  27.11 
 
 
872 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  22.41 
 
 
908 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  23.82 
 
 
924 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.34 
 
 
852 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.34 
 
 
852 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  24.6 
 
 
855 aa  69.7  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.34 
 
 
852 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.67 
 
 
847 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  26.7 
 
 
882 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  22.84 
 
 
908 aa  69.3  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.07 
 
 
1265 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.98 
 
 
869 aa  68.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  25.55 
 
 
893 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  23.92 
 
 
1205 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.28 
 
 
1465 aa  68.2  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  22.3 
 
 
1710 aa  68.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>