121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4880 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4880  helicase domain protein  100 
 
 		 713 aa  1454    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.756208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0781  helicase-like  38.83 
 
 		 699 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1048  helicase domain protein  35.66 
 
 		 729 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3328  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.73 
 
 		 717 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.953553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2029  helicase domain-containing protein  33.49 
 
 		 711 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0228  hypothetical protein  31.03 
 
 		 703 aa  204  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515095  normal  0.0720823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  25.92 
 
 		 849 aa  107  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 856 aa  94.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  25.75 
 
 		 828 aa  94  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.55 
 
 		 863 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  24.55 
 
 		 863 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  24.06 
 
 		 852 aa  80.9  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.33 
 
 		 868 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  23.04 
 
 		 858 aa  73.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  25.17 
 
 		 869 aa  68.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.58 
 
 		 1197 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.87 
 
 		 1032 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  25 
 
 		 723 aa  62  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 		 1166 aa  62  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  24.06 
 
 		 693 aa  60.8  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.48 
 
 		 800 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  23.08 
 
 		 882 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  23.18 
 
 		 874 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  29.55 
 
 		 1173 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  32.09 
 
 		 1770 aa  57.4  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  31.82 
 
 		 1173 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  37.33 
 
 		 1216 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.08 
 
 		 1056 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  31 
 
 		 1051 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.49 
 
 		 876 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.03 
 
 		 694 aa  54.7  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.11 
 
 		 785 aa  54.7  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.22 
 
 		 856 aa  54.3  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  31.03 
 
 		 901 aa  53.9  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 		 1203 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  29.81 
 
 		 1068 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  26.88 
 
 		 1165 aa  53.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  27.14 
 
 		 933 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  36 
 
 		 1187 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.66 
 
 		 1004 aa  52.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  31.3 
 
 		 998 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  35.48 
 
 		 967 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  25.69 
 
 		 729 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.96 
 
 		 845 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.83 
 
 		 1064 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  35.48 
 
 		 967 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  40.24 
 
 		 1942 aa  51.6  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  29.51 
 
 		 872 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  35.71 
 
 		 1003 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  22.92 
 
 		 898 aa  51.2  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  24.62 
 
 		 924 aa  51.6  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.85 
 
 		 1054 aa  51.2  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  28.85 
 
 		 1054 aa  51.2  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.21 
 
 		 780 aa  51.2  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  27.54 
 
 		 2208 aa  50.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  32.35 
 
 		 1175 aa  50.8  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1455  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.71 
 
 		 430 aa  50.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  23.45 
 
 		 402 aa  50.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.39 
 
 		 807 aa  50.8  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.07 
 
 		 1053 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.53 
 
 		 1085 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  22.72 
 
 		 2015 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.22 
 
 		 715 aa  49.7  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.73 
 
 		 706 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  32.29 
 
 		 726 aa  49.7  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.66 
 
 		 708 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.36 
 
 		 868 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.24 
 
 		 952 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  32.41 
 
 		 1185 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  29.75 
 
 		 908 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.62 
 
 		 739 aa  48.9  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  29.77 
 
 		 1068 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  34.48 
 
 		 712 aa  49.3  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.76 
 
 		 853 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  30.25 
 
 		 908 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.22 
 
 		 861 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.22 
 
 		 861 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  31.96 
 
 		 908 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.43 
 
 		 799 aa  48.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  37.04 
 
 		 1767 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  28.75 
 
 		 2157 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  30.93 
 
 		 908 aa  47.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.59 
 
 		 1205 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  25.94 
 
 		 861 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  30.59 
 
 		 760 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.3 
 
 		 861 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.22 
 
 		 709 aa  47.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  22.33 
 
 		 1710 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  31.96 
 
 		 853 aa  46.6  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.42 
 
 		 927 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  33.7 
 
 		 890 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.23 
 
 		 707 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.95 
 
 		 756 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.67 
 
 		 707 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  31 
 
 		 1073 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  32.14 
 
 		 926 aa  45.8  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  32.14 
 
 		 924 aa  45.8  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  34.38 
 
 		 927 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  36 
 
 		 1055 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  30.77 
 
 		 994 aa  45.8  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>