More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2007 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  76.87 
 
 
1056 aa  1603    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  48.3 
 
 
1051 aa  953    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  100 
 
 
1054 aa  2125    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1054 aa  2125    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  77.83 
 
 
1053 aa  1671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.11 
 
 
1085 aa  608  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  25.79 
 
 
760 aa  124  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.9 
 
 
1032 aa  122  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  27.7 
 
 
712 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.22 
 
 
1197 aa  115  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.7 
 
 
739 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  28.16 
 
 
729 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  28.12 
 
 
693 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.23 
 
 
694 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  26.17 
 
 
849 aa  112  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.89 
 
 
791 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  27.4 
 
 
723 aa  110  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  28.11 
 
 
824 aa  108  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.67 
 
 
715 aa  107  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  27.94 
 
 
1465 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.72 
 
 
780 aa  107  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.43 
 
 
1064 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.27 
 
 
1032 aa  107  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.05 
 
 
709 aa  106  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  26.59 
 
 
726 aa  105  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.06 
 
 
747 aa  104  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.57 
 
 
751 aa  104  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  27.35 
 
 
1173 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  26.75 
 
 
1767 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.15 
 
 
746 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  26.36 
 
 
1173 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.73 
 
 
756 aa  101  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  26.19 
 
 
727 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.49 
 
 
807 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.22 
 
 
863 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  27.22 
 
 
863 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.52 
 
 
868 aa  99.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.92 
 
 
803 aa  98.6  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  24.88 
 
 
2152 aa  97.8  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  26.97 
 
 
1165 aa  97.8  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.16 
 
 
785 aa  97.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  25.36 
 
 
882 aa  97.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.57 
 
 
799 aa  97.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  23.77 
 
 
1068 aa  95.5  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.6 
 
 
747 aa  95.1  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.45 
 
 
706 aa  94.4  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.55 
 
 
707 aa  94.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  25.18 
 
 
858 aa  92.8  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.99 
 
 
707 aa  92  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.75 
 
 
707 aa  92  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.14 
 
 
729 aa  92  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  25.06 
 
 
1060 aa  91.3  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  25.1 
 
 
933 aa  91.3  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.48 
 
 
800 aa  91.3  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.42 
 
 
662 aa  91.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  26.27 
 
 
2015 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  26.27 
 
 
1068 aa  90.5  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  23.37 
 
 
2208 aa  89  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.33 
 
 
1166 aa  88.6  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  32.54 
 
 
1385 aa  87.8  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  22.94 
 
 
2157 aa  85.9  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  28.36 
 
 
808 aa  85.9  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  22.33 
 
 
874 aa  85.5  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  25.12 
 
 
2111 aa  84.7  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.72 
 
 
710 aa  84.3  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  24.13 
 
 
1942 aa  84  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.97 
 
 
845 aa  83.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  22.74 
 
 
828 aa  82.4  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  33.16 
 
 
825 aa  82  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3576  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.27 
 
 
1048 aa  82.4  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  23.23 
 
 
1770 aa  80.9  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.9 
 
 
927 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  26.9 
 
 
927 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  34.19 
 
 
852 aa  80.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.42 
 
 
708 aa  80.1  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  26.38 
 
 
919 aa  79.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.3 
 
 
988 aa  79.3  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  26.15 
 
 
924 aa  79  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  26.7 
 
 
908 aa  78.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  23.93 
 
 
1216 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2283  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.91 
 
 
1220 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268234 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  25 
 
 
1710 aa  78.2  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  25.17 
 
 
1589 aa  77.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.24 
 
 
1265 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  26.27 
 
 
905 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.52 
 
 
868 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.12 
 
 
873 aa  77  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 
700 aa  76.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.05 
 
 
1205 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  24.68 
 
 
861 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.27 
 
 
817 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.51 
 
 
894 aa  75.5  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.7 
 
 
810 aa  74.7  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.26 
 
 
861 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  22.94 
 
 
872 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.26 
 
 
861 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  24.29 
 
 
402 aa  73.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  24.82 
 
 
908 aa  72.8  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  24.71 
 
 
908 aa  73.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.3 
 
 
852 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>