More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0947 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.47 
 
 		 1085 aa  646    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.39 
 
 		 1056 aa  880    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  100 
 
 		 1051 aa  2157    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.73 
 
 		 1054 aa  964    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.95 
 
 		 1053 aa  937    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  46.73 
 
 		 1054 aa  964    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.79 
 
 		 1064 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.84 
 
 		 1032 aa  121  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  25.64 
 
 		 849 aa  117  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.03 
 
 		 694 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.46 
 
 		 739 aa  115  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.8 
 
 		 1032 aa  115  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.42 
 
 		 706 aa  115  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  24.64 
 
 		 1942 aa  112  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.99 
 
 		 791 aa  112  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.43 
 
 		 863 aa  111  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  28.43 
 
 		 863 aa  111  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 868 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 		 803 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  27.39 
 
 		 869 aa  110  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.02 
 
 		 780 aa  108  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  23.56 
 
 		 712 aa  107  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  25.75 
 
 		 2152 aa  107  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.55 
 
 		 1166 aa  106  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  25.56 
 
 		 726 aa  106  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  24.31 
 
 		 1767 aa  106  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  24.77 
 
 		 1165 aa  104  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.22 
 
 		 952 aa  104  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.16 
 
 		 708 aa  103  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  25.3 
 
 		 824 aa  103  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  23.77 
 
 		 1173 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.88 
 
 		 799 aa  102  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.5 
 
 		 1197 aa  102  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  22.44 
 
 		 799 aa  101  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  25.12 
 
 		 1173 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.7 
 
 		 807 aa  101  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  23.87 
 
 		 2208 aa  101  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.64 
 
 		 800 aa  101  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.25 
 
 		 715 aa  100  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  26.64 
 
 		 760 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.75 
 
 		 785 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  24.18 
 
 		 2157 aa  100  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.08 
 
 		 729 aa  99.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  27.76 
 
 		 905 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  23.24 
 
 		 727 aa  99.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  26.81 
 
 		 2015 aa  98.6  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  23.41 
 
 		 882 aa  98.6  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  23.69 
 
 		 723 aa  98.6  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.66 
 
 		 747 aa  98.2  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.42 
 
 		 709 aa  98.2  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  26.16 
 
 		 729 aa  97.8  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  25.88 
 
 		 2189 aa  97.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.56 
 
 		 747 aa  97.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.06 
 
 		 746 aa  97.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  26.43 
 
 		 908 aa  95.9  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  26.94 
 
 		 908 aa  95.9  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  23.08 
 
 		 693 aa  95.9  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  26.48 
 
 		 852 aa  94.7  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  24.83 
 
 		 933 aa  94.7  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 		 1068 aa  94.4  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.31 
 
 		 1465 aa  94  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  25.32 
 
 		 919 aa  93.2  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  26.71 
 
 		 908 aa  93.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  27.4 
 
 		 908 aa  92.8  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  24.6 
 
 		 872 aa  92  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.31 
 
 		 835 aa  91.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  24.65 
 
 		 402 aa  91.3  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  23.06 
 
 		 1770 aa  91.3  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3765  helicase domain-containing protein  25.76 
 
 		 1103 aa  90.5  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  26.13 
 
 		 889 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.07 
 
 		 751 aa  90.1  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  25.39 
 
 		 808 aa  90.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.95 
 
 		 700 aa  89.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  24.49 
 
 		 2111 aa  89.7  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  24.88 
 
 		 998 aa  89.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.99 
 
 		 827 aa  89.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  25.72 
 
 		 926 aa  89  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.29 
 
 		 707 aa  89  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  26 
 
 		 1589 aa  88.2  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.36 
 
 		 847 aa  88.2  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  21.98 
 
 		 1187 aa  87.8  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  26.68 
 
 		 893 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  26.29 
 
 		 904 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  22.58 
 
 		 830 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.37 
 
 		 707 aa  86.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  26.02 
 
 		 924 aa  86.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.4 
 
 		 845 aa  85.9  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  26.3 
 
 		 927 aa  85.1  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.96 
 
 		 996 aa  85.1  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.07 
 
 		 927 aa  85.1  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.44 
 
 		 950 aa  84.7  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  25 
 
 		 916 aa  83.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.89 
 
 		 837 aa  83.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  24.82 
 
 		 924 aa  83.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  22.17 
 
 		 874 aa  82  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  24.52 
 
 		 924 aa  81.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.11 
 
 		 1110 aa  82  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000467672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.43 
 
 		 870 aa  82  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.51 
 
 		 756 aa  82  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  24.94 
 
 		 918 aa  81.6  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>