258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19790 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  100 
 
 		 852 aa  1736    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.95 
 
 		 863 aa  499  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  34.95 
 
 		 863 aa  499  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 		 868 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  33.72 
 
 		 869 aa  429  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  30.72 
 
 		 858 aa  295  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  28.44 
 
 		 849 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  31.87 
 
 		 828 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.72 
 
 		 267 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 856 aa  127  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  25.65 
 
 		 758 aa  99  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1051 aa  95.1  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.25 
 
 		 1085 aa  89.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.32 
 
 		 952 aa  88.6  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.27 
 
 		 1032 aa  87  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  24.77 
 
 		 2208 aa  84.7  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  24.75 
 
 		 2152 aa  82  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  27.93 
 
 		 726 aa  81.6  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1048  helicase domain protein  24.12 
 
 		 729 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  25.27 
 
 		 2157 aa  80.9  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.87 
 
 		 709 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  25.06 
 
 		 905 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.19 
 
 		 1054 aa  80.5  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  34.19 
 
 		 1054 aa  80.5  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  24.06 
 
 		 2189 aa  80.5  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.79 
 
 		 1053 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3328  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.71 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.953553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  24.45 
 
 		 872 aa  79  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  26.34 
 
 		 874 aa  78.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2029  helicase domain-containing protein  38.3 
 
 		 711 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4880  helicase domain protein  23.56 
 
 		 713 aa  77.8  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.756208 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  26.2 
 
 		 1710 aa  77.8  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.05 
 
 		 1056 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.36 
 
 		 803 aa  76.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.08 
 
 		 791 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  26.07 
 
 		 906 aa  75.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24 
 
 		 707 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.25 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.22 
 
 		 799 aa  74.3  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  24.32 
 
 		 824 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.06 
 
 		 785 aa  73.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  25.94 
 
 		 402 aa  73.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.37 
 
 		 780 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.81 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.43 
 
 		 739 aa  72  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.21 
 
 		 709 aa  71.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  23.73 
 
 		 1767 aa  71.6  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.73 
 
 		 707 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  24.76 
 
 		 908 aa  70.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  22.57 
 
 		 1770 aa  70.1  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  23.78 
 
 		 924 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2652  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.07 
 
 		 147 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18308  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  24.46 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  24.1 
 
 		 908 aa  68.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.42 
 
 		 919 aa  68.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.79 
 
 		 747 aa  67.8  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  23.86 
 
 		 908 aa  68.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  23.57 
 
 		 893 aa  67.8  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  31.98 
 
 		 926 aa  67.8  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.79 
 
 		 746 aa  67.8  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  24.34 
 
 		 799 aa  67  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  25.65 
 
 		 889 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  23.88 
 
 		 927 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  23.13 
 
 		 1942 aa  67.4  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.06 
 
 		 747 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  34.69 
 
 		 972 aa  66.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.9 
 
 		 1064 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0781  helicase-like  34.09 
 
 		 699 aa  67  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  23.4 
 
 		 927 aa  65.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.7 
 
 		 843 aa  65.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  24.71 
 
 		 1589 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  22.72 
 
 		 890 aa  65.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  25.18 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.93 
 
 		 1197 aa  65.5  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.94 
 
 		 861 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  30.91 
 
 		 924 aa  64.3  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.94 
 
 		 861 aa  64.3  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  23.3 
 
 		 952 aa  63.9  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.11 
 
 		 807 aa  63.9  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.79 
 
 		 1166 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  24.82 
 
 		 904 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  23.29 
 
 		 1173 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 		 833 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.67 
 
 		 950 aa  63.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  34.55 
 
 		 1055 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.33 
 
 		 981 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.26 
 
 		 751 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.69 
 
 		 1004 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  22.62 
 
 		 919 aa  62.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.39 
 
 		 762 aa  62.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  23.69 
 
 		 882 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  24.23 
 
 		 813 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  25.82 
 
 		 861 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  35.29 
 
 		 908 aa  62  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  35.92 
 
 		 924 aa  62  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  34.62 
 
 		 967 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  35.11 
 
 		 1165 aa  61.6  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  34.62 
 
 		 967 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.41 
 
 		 918 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 		 918 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>