More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3891 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.98 
 
 
1203 aa  1560    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  100 
 
 
1216 aa  2451    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  59.14 
 
 
1187 aa  1349    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.9 
 
 
1205 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2283  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.14 
 
 
1220 aa  536  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268234 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0285  putative DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.41 
 
 
1226 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  26.41 
 
 
882 aa  146  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  25.1 
 
 
1173 aa  146  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.8 
 
 
1197 aa  140  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  23.85 
 
 
1173 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.74 
 
 
1166 aa  119  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  28.26 
 
 
1165 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.43 
 
 
1032 aa  101  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.84 
 
 
715 aa  98.6  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.91 
 
 
1465 aa  96.3  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.78 
 
 
694 aa  93.2  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.07 
 
 
1032 aa  92.4  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  25.35 
 
 
693 aa  91.7  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.73 
 
 
1085 aa  86.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.93 
 
 
1054 aa  82  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.49 
 
 
1064 aa  82  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  23.93 
 
 
1054 aa  82  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  25.38 
 
 
729 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  26.43 
 
 
824 aa  81.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  25.58 
 
 
712 aa  77.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.32 
 
 
791 aa  76.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  29.2 
 
 
1767 aa  73.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  22.25 
 
 
2189 aa  73.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.99 
 
 
780 aa  72.8  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.32 
 
 
1004 aa  70.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  37.5 
 
 
961 aa  69.7  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  24.18 
 
 
723 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.11 
 
 
807 aa  68.6  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.9 
 
 
760 aa  67.8  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  33.17 
 
 
1060 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.58 
 
 
856 aa  66.6  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.38 
 
 
950 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.69 
 
 
707 aa  66.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.05 
 
 
861 aa  66.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.08 
 
 
838 aa  66.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.69 
 
 
847 aa  65.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.44 
 
 
817 aa  65.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.36 
 
 
947 aa  65.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.39 
 
 
739 aa  65.1  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.46 
 
 
950 aa  64.3  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.2 
 
 
799 aa  64.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.28 
 
 
707 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.29 
 
 
866 aa  64.3  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.05 
 
 
847 aa  64.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.05 
 
 
848 aa  64.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29 
 
 
707 aa  64.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.33 
 
 
803 aa  64.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.98 
 
 
894 aa  64.3  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  25.7 
 
 
2157 aa  63.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.82 
 
 
700 aa  63.5  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  35.05 
 
 
885 aa  63.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.33 
 
 
852 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.42 
 
 
1265 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.01 
 
 
873 aa  63.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
852 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
852 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.69 
 
 
870 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
851 aa  63.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.02 
 
 
747 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  32.79 
 
 
869 aa  63.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.05 
 
 
835 aa  63.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.65 
 
 
837 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.02 
 
 
747 aa  63.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29 
 
 
751 aa  63.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.71 
 
 
1231 aa  63.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.38 
 
 
836 aa  62.4  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  35.16 
 
 
916 aa  62  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  36.08 
 
 
885 aa  62  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  36.26 
 
 
952 aa  62  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  33.33 
 
 
904 aa  62  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
863 aa  62  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  28.89 
 
 
799 aa  62  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  33.33 
 
 
863 aa  62  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.41 
 
 
950 aa  61.6  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  26.46 
 
 
1770 aa  61.6  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.99 
 
 
827 aa  61.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  32.59 
 
 
808 aa  61.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  27.98 
 
 
830 aa  61.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.86 
 
 
952 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  31.96 
 
 
842 aa  61.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  37.36 
 
 
918 aa  60.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.53 
 
 
988 aa  60.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  32.61 
 
 
1185 aa  60.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  35.16 
 
 
972 aa  60.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.29 
 
 
951 aa  60.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.08 
 
 
933 aa  60.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.54 
 
 
746 aa  60.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  38 
 
 
877 aa  60.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.23 
 
 
869 aa  59.7  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  33.62 
 
 
1710 aa  60.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  35.16 
 
 
863 aa  60.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.42 
 
 
832 aa  59.7  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.02 
 
 
832 aa  60.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  25.67 
 
 
936 aa  60.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  29 
 
 
1589 aa  59.3  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>