75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1048 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1048  helicase domain protein  100 
 
 		 729 aa  1504    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3328  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.7 
 
 		 717 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.953553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4880  helicase domain protein  35.61 
 
 		 713 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.756208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0781  helicase-like  34.68 
 
 		 699 aa  344  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137503  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2029  helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 711 aa  283  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0228  hypothetical protein  28.1 
 
 		 703 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515095  normal  0.0720823 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  23.24 
 
 		 874 aa  84.3  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  24.67 
 
 		 828 aa  84.3  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  24.75 
 
 		 869 aa  84  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  24.12 
 
 		 852 aa  81.6  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.38 
 
 		 856 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  39.8 
 
 		 849 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  37.5 
 
 		 863 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 863 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.37 
 
 		 868 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  28.87 
 
 		 858 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.56 
 
 		 800 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  24.09 
 
 		 2157 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  30.77 
 
 		 729 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.57 
 
 		 780 aa  55.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.91 
 
 		 1166 aa  55.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.47 
 
 		 845 aa  55.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.07 
 
 		 807 aa  54.3  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.66 
 
 		 1064 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  22.3 
 
 		 1165 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.14 
 
 		 803 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 		 267 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  21.84 
 
 		 908 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.13 
 
 		 785 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  22.11 
 
 		 2111 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.2 
 
 		 1004 aa  52  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.23 
 
 		 1032 aa  51.2  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.62 
 
 		 1197 aa  51.2  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  24.1 
 
 		 842 aa  50.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  38.37 
 
 		 1767 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  26.06 
 
 		 1055 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  20.49 
 
 		 402 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.64 
 
 		 799 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.46 
 
 		 952 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  21.72 
 
 		 1942 aa  50.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.86 
 
 		 1230 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.85 
 
 		 1203 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  34.62 
 
 		 1185 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  22.27 
 
 		 1589 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  21.34 
 
 		 908 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.86 
 
 		 837 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.52 
 
 		 932 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  33.71 
 
 		 1175 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  28.7 
 
 		 1173 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  34.04 
 
 		 1216 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.49 
 
 		 851 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  34.02 
 
 		 872 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.51 
 
 		 747 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.53 
 
 		 933 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.29 
 
 		 791 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  24.19 
 
 		 926 aa  45.8  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  35.8 
 
 		 998 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  31.4 
 
 		 1173 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.64 
 
 		 1085 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  35.35 
 
 		 1068 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2285  helicase domain protein  32.99 
 
 		 550 aa  45.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  22.97 
 
 		 924 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  25.6 
 
 		 972 aa  45.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  27.59 
 
 		 901 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  31.07 
 
 		 1054 aa  45.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.07 
 
 		 1054 aa  45.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90571  RNA helicase of DEAD box family  23.46 
 
 		 509 aa  44.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0907295  normal  0.0189546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 706 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1455  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.42 
 
 		 430 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1051 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 		 861 aa  44.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  21.92 
 
 		 903 aa  44.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  32.95 
 
 		 882 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.04 
 
 		 810 aa  43.9  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  22.17 
 
 		 1465 aa  43.9  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>