123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2029 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2029  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 711 aa  1459    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0781  helicase-like  34.22 
 
 		 699 aa  323  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3328  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 		 717 aa  294  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.953553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4880  helicase domain protein  33.6 
 
 		 713 aa  291  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.756208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1048  helicase domain protein  30.88 
 
 		 729 aa  283  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0228  hypothetical protein  29.43 
 
 		 703 aa  249  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515095  normal  0.0720823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  29.04 
 
 		 858 aa  111  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  29.76 
 
 		 828 aa  104  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.58 
 
 		 856 aa  103  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.95 
 
 		 863 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  25.95 
 
 		 863 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  25.35 
 
 		 849 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  26.92 
 
 		 869 aa  87.8  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  38.3 
 
 		 852 aa  78.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.54 
 
 		 1032 aa  67.8  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.21 
 
 		 868 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.51 
 
 		 1054 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  24.51 
 
 		 1054 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.05 
 
 		 785 aa  60.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.89 
 
 		 1056 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.04 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.09 
 
 		 800 aa  58.9  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  22.38 
 
 		 874 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.46 
 
 		 1085 aa  58.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  25.46 
 
 		 2157 aa  58.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  40.28 
 
 		 1216 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  23.03 
 
 		 723 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.34 
 
 		 709 aa  55.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  24.86 
 
 		 712 aa  55.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  27.6 
 
 		 1173 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  25 
 
 		 1173 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.87 
 
 		 807 aa  53.9  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  37.33 
 
 		 1187 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 		 1203 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  34.52 
 
 		 926 aa  51.6  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  25.55 
 
 		 693 aa  51.6  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.73 
 
 		 1205 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  34.52 
 
 		 924 aa  50.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  24.67 
 
 		 760 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.77 
 
 		 1166 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  34.52 
 
 		 924 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0285  putative DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.53 
 
 		 1226 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.48 
 
 		 1053 aa  50.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  21.02 
 
 		 1155 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  26.2 
 
 		 1165 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.96 
 
 		 1197 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.73 
 
 		 667 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  26.63 
 
 		 882 aa  49.3  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  23.16 
 
 		 2111 aa  49.3  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.25 
 
 		 952 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  25.13 
 
 		 2015 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  28.16 
 
 		 758 aa  47.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.98 
 
 		 691 aa  47.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  24.86 
 
 		 824 aa  47.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  21.91 
 
 		 1246 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  21.94 
 
 		 1148 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  21.94 
 
 		 1164 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1051 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  21.2 
 
 		 1179 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.1 
 
 		 866 aa  47.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  20.27 
 
 		 1178 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  30.97 
 
 		 1055 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  29.13 
 
 		 402 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  21.94 
 
 		 1148 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  21.94 
 
 		 1148 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  21.94 
 
 		 1164 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  21.94 
 
 		 1148 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  21.94 
 
 		 1148 aa  47  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.87 
 
 		 827 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01118  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1148 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.451631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  21.45 
 
 		 893 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.39 
 
 		 820 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.83 
 
 		 865 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  24.48 
 
 		 726 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  21.78 
 
 		 893 aa  46.6  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.31 
 
 		 950 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  27.78 
 
 		 1207 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  33.33 
 
 		 924 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.78 
 
 		 893 aa  46.6  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.23 
 
 		 876 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1494  transcription-repair coupling factor  21.65 
 
 		 1148 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44461  normal  0.168665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  20.43 
 
 		 1164 aa  45.8  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  23.56 
 
 		 1150 aa  45.8  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  30.93 
 
 		 967 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  20.56 
 
 		 1265 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.8 
 
 		 1102 aa  45.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.94 
 
 		 791 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.63 
 
 		 847 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.94 
 
 		 799 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  30.93 
 
 		 967 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.74 
 
 		 715 aa  45.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  29.76 
 
 		 729 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  25.9 
 
 		 908 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0938  helicase domain-containing protein  28.26 
 
 		 789 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  24.61 
 
 		 842 aa  45.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  21.53 
 
 		 1151 aa  45.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  31.96 
 
 		 1003 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  30.59 
 
 		 799 aa  45.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  35.29 
 
 		 1767 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.11 
 
 		 1004 aa  45.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>