More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90571 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_10417  ATP-dependent RNA helicase (Eurofung)  79.46 
 
 
498 aa  695    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.880025  hitchhiker  0.000000252521 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90571  RNA helicase of DEAD box family  100 
 
 
509 aa  1052    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0907295  normal  0.0189546 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06460  RNA helicase, putative  73.57 
 
 
625 aa  633  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49732  predicted protein  71.61 
 
 
419 aa  606  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0305242 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25743  predicted protein  46.22 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.628861  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08016  ATP-dependent RNA helicase fal1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUL4]  41.29 
 
 
399 aa  306  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.687737  normal  0.0336858 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06360  conserved hypothetical protein  42.36 
 
 
396 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74636  Eukaryotic initiation factor 4A (eIF4A) (eIF-4A)  45.11 
 
 
397 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.471027  normal  0.975431 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32748  predicted protein  42.7 
 
 
413 aa  296  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0334317  normal  0.0803599 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.58 
 
 
405 aa  296  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41785  predicted protein  43.68 
 
 
370 aa  293  7e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.982896  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26958  predicted protein  39.3 
 
 
404 aa  291  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0164811 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02932  ATP-dependent RNA helicase eIF4A (EC 3.6.1.-)(Eukaryotic initiation factor 4A)(eIF-4A)(Translation initiation factor 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B948]  42.82 
 
 
398 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07620  translation initiation factor, putative  43.09 
 
 
401 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52941  RNA helicase involved in maturation of 18S rRNA  39.73 
 
 
399 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0572699  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.55 
 
 
657 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.67 
 
 
584 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.59 
 
 
565 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.17 
 
 
590 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.42 
 
 
530 aa  269  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  41.53 
 
 
530 aa  266  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.35 
 
 
541 aa  266  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.71 
 
 
425 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  38.81 
 
 
527 aa  265  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.21 
 
 
466 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.4 
 
 
539 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_51301  predicted protein  40.31 
 
 
428 aa  263  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.68 
 
 
614 aa  264  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.75 
 
 
528 aa  263  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37 
 
 
533 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.74 
 
 
527 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  37.7 
 
 
531 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.81 
 
 
583 aa  261  3e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.83 
 
 
532 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.85 
 
 
550 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  37.74 
 
 
452 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.23 
 
 
454 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.54 
 
 
450 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  39.57 
 
 
411 aa  259  8e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.54 
 
 
458 aa  259  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.81 
 
 
450 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.47 
 
 
532 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  36.54 
 
 
450 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.54 
 
 
450 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  38.25 
 
 
589 aa  259  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.54 
 
 
450 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  36.54 
 
 
450 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  39.39 
 
 
445 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.54 
 
 
450 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  39.57 
 
 
420 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.98 
 
 
449 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.79 
 
 
549 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  37.57 
 
 
521 aa  257  4e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  38.31 
 
 
641 aa  256  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.9 
 
 
453 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.06 
 
 
454 aa  256  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.98 
 
 
453 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.46 
 
 
466 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  37.06 
 
 
454 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.06 
 
 
454 aa  256  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  37.53 
 
 
482 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.53 
 
 
482 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.06 
 
 
455 aa  256  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  37.53 
 
 
482 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  35.75 
 
 
435 aa  256  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.06 
 
 
454 aa  256  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.53 
 
 
482 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.42 
 
 
456 aa  256  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.06 
 
 
454 aa  256  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  37.53 
 
 
481 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  37.06 
 
 
454 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  37.53 
 
 
482 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.7 
 
 
643 aa  256  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.53 
 
 
571 aa  256  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.94 
 
 
545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.06 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07200  ATP dependent RNA helicase, putative  38.85 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.117946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  37.53 
 
 
559 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  36.78 
 
 
656 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  38.57 
 
 
527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.23 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.24 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.53 
 
 
509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  36.91 
 
 
551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.11 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.39 
 
 
618 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.37 
 
 
460 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  37.19 
 
 
579 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.57 
 
 
520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  37.57 
 
 
520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.03 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.57 
 
 
520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.33 
 
 
453 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.33 
 
 
453 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.03 
 
 
455 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 
578 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.33 
 
 
453 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.33 
 
 
453 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2529  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.57 
 
 
426 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
503 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>