More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_49732 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_10417  ATP-dependent RNA helicase (Eurofung)  74.01 
 
 
498 aa  638    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.880025  hitchhiker  0.000000252521 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49732  predicted protein  100 
 
 
419 aa  872    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0305242 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06460  RNA helicase, putative  70.57 
 
 
625 aa  608  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90571  RNA helicase of DEAD box family  71.61 
 
 
509 aa  604  9.999999999999999e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0907295  normal  0.0189546 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25743  predicted protein  41.03 
 
 
414 aa  299  6e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.628861  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08016  ATP-dependent RNA helicase fal1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUL4]  41.03 
 
 
399 aa  293  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.687737  normal  0.0336858 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06360  conserved hypothetical protein  39.67 
 
 
396 aa  290  4e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26958  predicted protein  37.77 
 
 
404 aa  285  9e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74636  Eukaryotic initiation factor 4A (eIF4A) (eIF-4A)  42.01 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.471027  normal  0.975431 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52941  RNA helicase involved in maturation of 18S rRNA  40.11 
 
 
399 aa  283  5.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0572699  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07620  translation initiation factor, putative  40.6 
 
 
401 aa  279  6e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02932  ATP-dependent RNA helicase eIF4A (EC 3.6.1.-)(Eukaryotic initiation factor 4A)(eIF-4A)(Translation initiation factor 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B948]  40.27 
 
 
398 aa  276  7e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41785  predicted protein  39.01 
 
 
370 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.982896  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32748  predicted protein  38.59 
 
 
413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0334317  normal  0.0803599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.32 
 
 
590 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.43 
 
 
460 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  39.07 
 
 
530 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.93 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.02 
 
 
584 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.48 
 
 
539 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  38.48 
 
 
527 aa  257  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_51301  predicted protein  37.53 
 
 
428 aa  256  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.08 
 
 
541 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.57 
 
 
538 aa  255  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.91 
 
 
530 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  35.96 
 
 
559 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.71 
 
 
527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.52 
 
 
532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.62 
 
 
571 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.78 
 
 
528 aa  254  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.41 
 
 
511 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  36.74 
 
 
481 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  36.74 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.74 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  36.74 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.74 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  36.74 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.29 
 
 
482 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  37.01 
 
 
529 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.32 
 
 
509 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.5 
 
 
466 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.66 
 
 
533 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.24 
 
 
450 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.68 
 
 
643 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.46 
 
 
489 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  37.36 
 
 
551 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.72 
 
 
525 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.11 
 
 
511 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.5 
 
 
467 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.72 
 
 
525 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.72 
 
 
528 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.24 
 
 
450 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  36.72 
 
 
528 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  36.24 
 
 
450 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  36.72 
 
 
528 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  36.24 
 
 
450 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.72 
 
 
528 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.37 
 
 
527 aa  250  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.72 
 
 
528 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.24 
 
 
450 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  36.72 
 
 
533 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.24 
 
 
450 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.99 
 
 
614 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2710  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.87 
 
 
428 aa  250  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.14 
 
 
550 aa  250  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.78 
 
 
454 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.34 
 
 
536 aa  249  7e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.24 
 
 
458 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.19 
 
 
497 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.24 
 
 
450 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  34.86 
 
 
527 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.04 
 
 
462 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.34 
 
 
657 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  35.11 
 
 
520 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.11 
 
 
520 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.22 
 
 
532 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.11 
 
 
520 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.61 
 
 
482 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.43 
 
 
565 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.04 
 
 
474 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.15 
 
 
453 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.15 
 
 
453 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.16 
 
 
583 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.15 
 
 
453 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.15 
 
 
453 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.15 
 
 
453 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.04 
 
 
466 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.62 
 
 
498 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  36.41 
 
 
528 aa  246  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.44 
 
 
595 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  35.91 
 
 
491 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  35.51 
 
 
411 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.08 
 
 
571 aa  246  6.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.04 
 
 
454 aa  245  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  35.51 
 
 
420 aa  245  8e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  36.04 
 
 
454 aa  245  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.04 
 
 
454 aa  245  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.04 
 
 
455 aa  245  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  36.04 
 
 
454 aa  245  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.04 
 
 
454 aa  245  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>