More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51301 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011700  PHATRDRAFT_51301  predicted protein  100 
 
 
428 aa  880    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07200  ATP dependent RNA helicase, putative  66.28 
 
 
442 aa  600  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.117946  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83587  Suppressor of the cold-sensitive snRNP biogenesis mutant brr1-1  63.89 
 
 
433 aa  578  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89708  predicted protein  65.08 
 
 
358 aa  499  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0807032 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08722  ATP-dependent RNA helicase sub2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASK8]  59.64 
 
 
369 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06460  RNA helicase, putative  39.59 
 
 
625 aa  269  8e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10417  ATP-dependent RNA helicase (Eurofung)  40.16 
 
 
498 aa  266  5.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.880025  hitchhiker  0.000000252521 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90571  RNA helicase of DEAD box family  40 
 
 
509 aa  265  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0907295  normal  0.0189546 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49732  predicted protein  37.53 
 
 
419 aa  256  6e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0305242 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52941  RNA helicase involved in maturation of 18S rRNA  36.98 
 
 
399 aa  247  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0572699  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.9 
 
 
565 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08016  ATP-dependent RNA helicase fal1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUL4]  37.23 
 
 
399 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.687737  normal  0.0336858 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.76 
 
 
405 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25743  predicted protein  36.22 
 
 
414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.628861  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41785  predicted protein  36.22 
 
 
370 aa  236  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.982896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.28 
 
 
557 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.28 
 
 
557 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.28 
 
 
557 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.39 
 
 
532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07620  translation initiation factor, putative  39.68 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.12 
 
 
664 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.81 
 
 
602 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32748  predicted protein  35.68 
 
 
413 aa  233  5e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0334317  normal  0.0803599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.42 
 
 
590 aa  233  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  38.9 
 
 
530 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.85 
 
 
664 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.85 
 
 
536 aa  232  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.85 
 
 
664 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.71 
 
 
655 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.04 
 
 
629 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.04 
 
 
629 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.04 
 
 
629 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.58 
 
 
653 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.04 
 
 
629 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06360  conserved hypothetical protein  36.17 
 
 
396 aa  230  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.45 
 
 
651 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.45 
 
 
651 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.45 
 
 
651 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.04 
 
 
629 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  37.32 
 
 
595 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.88 
 
 
643 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.69 
 
 
550 aa  229  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.02 
 
 
694 aa  229  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26958  predicted protein  35.12 
 
 
404 aa  229  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0164811 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  36.04 
 
 
629 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.04 
 
 
629 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.07 
 
 
525 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  36.86 
 
 
533 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.86 
 
 
528 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  36.86 
 
 
528 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  36.86 
 
 
528 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  37.07 
 
 
525 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.86 
 
 
528 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.04 
 
 
629 aa  229  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.04 
 
 
629 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.86 
 
 
528 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  36.04 
 
 
629 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.04 
 
 
629 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 
525 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  36.57 
 
 
529 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.41 
 
 
515 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.51 
 
 
533 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.01 
 
 
589 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 
525 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.31 
 
 
625 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 
526 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.78 
 
 
538 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.28 
 
 
614 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02932  ATP-dependent RNA helicase eIF4A (EC 3.6.1.-)(Eukaryotic initiation factor 4A)(eIF-4A)(Translation initiation factor 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B948]  37.8 
 
 
398 aa  226  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.77 
 
 
621 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.85 
 
 
599 aa  226  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.77 
 
 
466 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
605 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
610 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.92 
 
 
480 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  35.89 
 
 
609 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.98 
 
 
591 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.56 
 
 
599 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.89 
 
 
609 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.51 
 
 
491 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 
623 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  33.6 
 
 
656 aa  224  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  36.96 
 
 
484 aa  223  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  35.12 
 
 
590 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  34.29 
 
 
591 aa  223  4.9999999999999996e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  35.82 
 
 
574 aa  223  6e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  35.86 
 
 
614 aa  223  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.67 
 
 
640 aa  223  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2611  DEAD/DEAH box helicase-like  33.95 
 
 
500 aa  223  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000048378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.16 
 
 
747 aa  223  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.16 
 
 
597 aa  222  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  34.74 
 
 
563 aa  222  9e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.64 
 
 
602 aa  222  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.78 
 
 
528 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2040  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.39 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.28 
 
 
527 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.38 
 
 
640 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.38 
 
 
640 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.38 
 
 
640 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.56 
 
 
624 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>