More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07200 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA07200  ATP dependent RNA helicase, putative  100 
 
 
442 aa  915    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.117946  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83587  Suppressor of the cold-sensitive snRNP biogenesis mutant brr1-1  69.59 
 
 
433 aa  634    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_51301  predicted protein  66.75 
 
 
428 aa  591  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89708  predicted protein  67.88 
 
 
358 aa  508  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0807032 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08722  ATP-dependent RNA helicase sub2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASK8]  65.45 
 
 
369 aa  471  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08016  ATP-dependent RNA helicase fal1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUL4]  39.2 
 
 
399 aa  262  8.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.687737  normal  0.0336858 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90571  RNA helicase of DEAD box family  38.95 
 
 
509 aa  256  6e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0907295  normal  0.0189546 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06460  RNA helicase, putative  38.68 
 
 
625 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41785  predicted protein  38.11 
 
 
370 aa  252  8.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.982896  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06360  conserved hypothetical protein  37.99 
 
 
396 aa  251  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25743  predicted protein  36.76 
 
 
414 aa  250  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.628861  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52941  RNA helicase involved in maturation of 18S rRNA  35.82 
 
 
399 aa  248  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0572699  normal  0.201544 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10417  ATP-dependent RNA helicase (Eurofung)  37.37 
 
 
498 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.880025  hitchhiker  0.000000252521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.14 
 
 
590 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26958  predicted protein  35.48 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.44 
 
 
651 aa  243  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.44 
 
 
651 aa  243  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.44 
 
 
651 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32748  predicted protein  35.89 
 
 
413 aa  242  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0334317  normal  0.0803599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  36.76 
 
 
629 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.76 
 
 
629 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.76 
 
 
629 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  36.76 
 
 
629 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.93 
 
 
532 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.76 
 
 
629 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.76 
 
 
629 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49732  predicted protein  34.12 
 
 
419 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0305242 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74636  Eukaryotic initiation factor 4A (eIF4A) (eIF-4A)  40.05 
 
 
397 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.471027  normal  0.975431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.71 
 
 
643 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.76 
 
 
655 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.49 
 
 
629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.49 
 
 
629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.49 
 
 
629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.49 
 
 
629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02932  ATP-dependent RNA helicase eIF4A (EC 3.6.1.-)(Eukaryotic initiation factor 4A)(eIF-4A)(Translation initiation factor 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B948]  36.74 
 
 
398 aa  240  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.29 
 
 
405 aa  240  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.49 
 
 
629 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.54 
 
 
565 aa  239  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.29 
 
 
557 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.29 
 
 
557 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.29 
 
 
557 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.68 
 
 
653 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07620  translation initiation factor, putative  37.34 
 
 
401 aa  236  7e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.83 
 
 
591 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.25 
 
 
533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38 
 
 
525 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  38 
 
 
528 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  38 
 
 
525 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.29 
 
 
538 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38 
 
 
528 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  38 
 
 
528 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  38 
 
 
533 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  38 
 
 
529 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38 
 
 
528 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.5 
 
 
550 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  38 
 
 
528 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.68 
 
 
625 aa  233  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.14 
 
 
621 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.86 
 
 
664 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.93 
 
 
527 aa  232  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.86 
 
 
664 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.71 
 
 
511 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.86 
 
 
664 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.14 
 
 
542 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0042601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.77 
 
 
632 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.04 
 
 
595 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.77 
 
 
605 aa  229  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.78 
 
 
539 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.21 
 
 
599 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  34.05 
 
 
656 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.78 
 
 
602 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.78 
 
 
589 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 
640 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  34.58 
 
 
580 aa  227  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  34.48 
 
 
531 aa  226  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.54 
 
 
597 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.54 
 
 
599 aa  226  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 
623 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.77 
 
 
532 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.47 
 
 
640 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.32 
 
 
624 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.47 
 
 
640 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.06 
 
 
610 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.47 
 
 
640 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  35.33 
 
 
563 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  33.42 
 
 
591 aa  224  2e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.47 
 
 
640 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  36.02 
 
 
521 aa  224  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  37.71 
 
 
485 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  36.54 
 
 
609 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.82 
 
 
532 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.54 
 
 
609 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.55 
 
 
584 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.21 
 
 
589 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.9 
 
 
581 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2144  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.61 
 
 
560 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101709  normal  0.616746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  35.86 
 
 
530 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  35.52 
 
 
484 aa  223  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5247  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.97 
 
 
481 aa  223  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1775  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  35.79 
 
 
562 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>