206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1259 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 259 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  54.63 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  54.19 
 
 		 277 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  53.91 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  52.86 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  53.91 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  53.54 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  50.19 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  51.29 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  45.72 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  52.4 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  46.59 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  50.43 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  50.43 
 
 		 279 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  48.28 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  24.34 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  22.79 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  24.34 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.25 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  21.7 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  24.18 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  22.09 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  21.21 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  23.5 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  21.65 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  20.78 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  20.78 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  20.78 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  20.78 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  21.59 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  22.71 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24.02 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  21.86 
 
 		 413 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  22.61 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  23.73 
 
 		 372 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  22.48 
 
 		 413 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  38.36 
 
 		 305 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.11 
 
 		 344 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.71 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.96 
 
 		 162 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  20.78 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  32.29 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  21.21 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  23.74 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  23.28 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  36.99 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  26.53 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  24.09 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  24.78 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.31 
 
 		 571 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  24.76 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.61 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  31.58 
 
 		 440 aa  50.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1438  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 375 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2943  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 375 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1411  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 375 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 479 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.22 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  24.2 
 
 		 199 aa  48.9  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 323 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  23.68 
 
 		 481 aa  48.9  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1402  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 375 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  38.16 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  24.57 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  23.5 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  23.5 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  38.2 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  22.32 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  22.77 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  29.59 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  23.68 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  22.73 
 
 		 430 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  23.35 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.57 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  20.93 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>