138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3158 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  65.43 
 
 
293 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  67.97 
 
 
278 aa  358  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  69.35 
 
 
278 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  68.95 
 
 
279 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  66.53 
 
 
255 aa  344  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  68.62 
 
 
270 aa  344  8.999999999999999e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  69.01 
 
 
272 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  64.41 
 
 
271 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  54.74 
 
 
283 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  52.59 
 
 
291 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  50.84 
 
 
277 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  50 
 
 
276 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  50.84 
 
 
273 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  46.59 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
413 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.96 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  25.53 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.68 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 
259 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  26.11 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.11 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 
260 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 
260 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 
260 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.11 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.11 
 
 
260 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.11 
 
 
260 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.11 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.29 
 
 
571 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  25.33 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 
382 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.78 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  21.83 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  23.28 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.64 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  22.27 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.45 
 
 
250 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.21 
 
 
503 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  21.85 
 
 
258 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
430 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  21.97 
 
 
263 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  24.34 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  26.01 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 
479 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  26.01 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  23.94 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 
227 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 
335 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  22.81 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 
248 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
297 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.68 
 
 
260 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  24.47 
 
 
405 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.78 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  31.39 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  25.65 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  25.21 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  21.97 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  24.88 
 
 
481 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  28.5 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  19.37 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  23.14 
 
 
372 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  23.2 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 
267 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  21.07 
 
 
323 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  25.11 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  22.79 
 
 
243 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  21.37 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  25.33 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 
404 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  26.5 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
683 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>