118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1185 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  97.49 
 
 		 278 aa  550  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  68.95 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  64.79 
 
 		 278 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  64.02 
 
 		 293 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  66.67 
 
 		 270 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  66.38 
 
 		 255 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  66.12 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  67.25 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  54.01 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  50.84 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  52.36 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  53.28 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  53.22 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  50.43 
 
 		 259 aa  231  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.33 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  24.89 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.25 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.9 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  26.18 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.81 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.07 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 345 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.35 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  23.68 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.14 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 430 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 		 520 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 409 aa  52.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  23.85 
 
 		 241 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  24.02 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  23.91 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.91 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.91 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.91 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.91 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.52 
 
 		 571 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 213 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24.57 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  21.49 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  24.47 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.59 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  26.01 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  23.08 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.36 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  23.28 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.67 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  23.25 
 
 		 302 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  23.36 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  23.04 
 
 		 309 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  22.42 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  28.63 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 699 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  22.5 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  21.01 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  22.14 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>