174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1438 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 278 aa  563  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  74.29 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  72.73 
 
 		 270 aa  362  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  70.85 
 
 		 255 aa  361  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  67.97 
 
 		 285 aa  359  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  68.08 
 
 		 272 aa  352  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  66.54 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  65.92 
 
 		 279 aa  346  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  66.95 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  56.85 
 
 		 277 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  56.35 
 
 		 273 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  56.85 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  54.69 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  55.79 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  52.61 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.44 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.74 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.18 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  25.75 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.85 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  27.35 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.35 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.35 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.35 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.35 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.35 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.12 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.54 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.22 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  25.2 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.19 
 
 		 571 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  21.79 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  24.77 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  23.77 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  23.29 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  24.47 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  24.15 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 413 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  22.98 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  26.09 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 		 520 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.44 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  22.41 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 		 372 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  25.88 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 345 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  23.22 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  21.43 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  22.12 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  25.94 
 
 		 481 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  22.32 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  27.84 
 
 		 300 aa  48.9  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  25.75 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 		 405 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>