155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2784 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  81.56 
 
 		 255 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  75.21 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  65.43 
 
 		 285 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  70.12 
 
 		 270 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  68.33 
 
 		 272 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  64.39 
 
 		 278 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  64.02 
 
 		 279 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  65.55 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  54.51 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  54.1 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  52.16 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  54.51 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  52.85 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  45.72 
 
 		 259 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  26.58 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  29.31 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  26.5 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.07 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.51 
 
 		 571 aa  62.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  22.81 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.5 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.54 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  23.25 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  26.01 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  21.9 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.86 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.54 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.57 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  29.49 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  23.68 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.26 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  25.69 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  24.68 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.68 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.68 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  22 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  24.2 
 
 		 244 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.68 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.68 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  24.18 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  22.5 
 
 		 258 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 302 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 259 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  23.73 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24.26 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  24.72 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  21.4 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  24.48 
 
 		 503 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 520 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  22.47 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  22.97 
 
 		 260 aa  49.3  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 		 227 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>